Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms