Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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