Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col5a3Q9JLI2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms