Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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