Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CtsmQ9JL96 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtsmQ9JL96 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms