Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pole3Q9JKP7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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