Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms