Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scamp5Q9JKD3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scamp5Q9JKD3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms