Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms