Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efcc1Q9JJF6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms