Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc86Q9JJ89 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc86Q9JJ89 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc86Q9JJ89 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ccdc86Q9JJ89 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc86Q9JJ89 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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