Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smad9Q9JIW5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms