Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms