Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rb1cc1Q9ESK9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms