Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc28a3Q9ERH8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms