Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RhojQ9ER71 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms