Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms