Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r44Q9EQ47 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms