Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tspan4Q9DCK3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tspan4Q9DCK3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms