Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms