Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms