Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrpraQ9DBG7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms