Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ftsj3Q9DBE9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ftsj3Q9DBE9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms