Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9DA42 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9DA42 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9DA42 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9DA42 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9DA42 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms