Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms