Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cib4Q9D9N5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cib4Q9D9N5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cib4Q9D9N5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms