Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D9D9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Q9D9D9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q9D9D9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q9D9D9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q9D9D9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q9D9D9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Q9D9D9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D9D9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Q9D9D9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D9D9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms