Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cntd1Q9D995 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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