Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D979 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D979 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D979 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D979 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D979 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D979 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D979 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9D979 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms