Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rexo2Q9D8S4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rexo2Q9D8S4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms