Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl4Q9D8E6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms