Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Capn9Q9D805 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms