Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp4cQ9D7F7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp4cQ9D7F7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms