Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nop56Q9D6Z1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nop56Q9D6Z1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nop56Q9D6Z1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nop56Q9D6Z1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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