Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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Borcs6Q9D6W8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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Borcs6Q9D6W8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Borcs6Q9D6W8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Borcs6Q9D6W8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Borcs6Q9D6W8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Borcs6Q9D6W8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs6Q9D6W8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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