Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms