Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc39Q9D5Y1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms