Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PudpQ9D5U5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PudpQ9D5U5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PudpQ9D5U5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PudpQ9D5U5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PudpQ9D5U5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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