Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sf3a3Q9D554 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a3Q9D554 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms