Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc7Q9D541 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms