Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms