Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc105Q9D4K7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms