Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lonrf3Q9D4H7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms