Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms