Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Katnal2Q9D3R6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Katnal2Q9D3R6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms