Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms