Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klhdc8bQ9D2D9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klhdc8bQ9D2D9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms