Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snapc3Q9D2C9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snapc3Q9D2C9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms