Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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