Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krtap5-3Q9D226 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap5-3Q9D226 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms